《变形金钢2：卷土重来》是改编自同名电影「变形金钢」的动作游戏，故事主要在叙述银河系两大机械人种博派与狂派的斗争。
狂派首脑「密卡登」为了称霸宇宙，来到地球找回能为无生命物体注入生命能量的「火种源」，因此展开了一连串袭击地球的行动。
为了阻止疯狂行径的博派，为了保护这一切，他们不惜牺牲性命奋力一战。
游戏开始的第一关为训练关卡，主要让玩家熟悉所有的操作与攻击，碍于训练关卡英文讲解的部份较多，为了避免玩家卡关，故以较详细的方式呈现。
TrainingZone：1.训练关卡开始时，系统会要求你利用左类比摇杆进行走路与跑步的动作，以及使用右类比摇杆移动视点。
2.完成a动作后，接下来即是使用十字键的上、下，来调整视点的远近。
3.使用手把上的A键进行跳跃。
4.使用B键爬上墙壁至指定地点。
5.利用1~4的操作方法，捡取三颗光球。
6.使用X键进行近身肉搏，击倒三个目标。
7.输入手把指令X、X、X，进行三次连击的连续技，或按住X键进行聚气，放开后便能进行攻击。
8.使用Y键进行特殊攻击（SpecialAbility）。
9.到达屋顶后，按住手把LT键进入武器模式；当进入武器模式时，按下手把RT键发射武器。
10.进入武器模式时，按下手把RB键切换主副武器。
11.按住手把RT键，进入变形车模式，放开RT键便能恢复回原形。
12.于变形车模式（VehicleMode）下，按下手把LT键刹车。
13.于变形车模式（VehicleMode）下，按下手把X键发射武器。
14.于变形车模式（VehicleMode）下，长押手把A键，然后放开RT键，作出加速跳跃动作。
15.于变形车模式（VehicleMode）下，长押手把X键，然后放开RT键，作出转身跳踢动作。
16.于变形车模式（VehicleMode）下，长押手把B键，然后放开RT键，作空中坠击动作。
17.利用8~16的操作方法，击倒指定敌人。
18.按下手把LT键进入武器模式后，按下右类比摇杆（RS）找寻四位目标，并且狙击他们。
19.按住手把RT键进入飞行模式（FlightMode），并且碰触五个光球。
20.于飞行模式（FlightMode）下，按下手把A键进行加速冲刺。
21.于飞行模式（FlightMode）下，按下手把B键并配合左类比摇杆进行紧急闪躲。
22.于飞行模式（FlightMode）下，按下手把X键发射武器。
23..于飞行模式（FlightMode）下，长押手把X键，然后放开RT键，作空中坠击动作。
完成以上动作后，本关结束。
在一个繁华的都市，汽车人与人类和谐共处。
然而一场突如其来的危机打破了这份宁静，邪恶的霸天虎军团再次崛起，他们企图征服地球。
为了应对这场危机，汽车人领袖擎天柱带领着他的队伍与人类盟友们紧密合作。
其中有一位年轻的科学家小明，他与汽车人之间有着特殊的联系。
在一次激烈的战斗中，小明意外发现了一种神秘的能量源。
这种能量源似乎与变形金刚的力量有着紧密的关联，他决定深入研究这种能量源，希望能够找到对抗霸天虎的关键。
随着研究的深入，小明逐渐揭开了一个惊人的秘密。
原来这种能量源不仅能够赋予变形金刚更强大的力量，还能使他们进行超乎想象的变形。
小明决定与擎天柱分享这个发现。
擎天柱深知这一发现的重要性，但同时也意识到其中潜藏的巨大危险。
如果霸天虎得到了这种能量，后果将不堪设想。
于是他决定带领汽车人展开一场殊死的保卫战。
在激烈的战斗中，小明和汽车人们不断尝试着利用神秘能量源的力量。
他们发现通过合理运用这种能量，他们能够使变形金刚的形态变得更加多样化，从而在战斗中取得优势。
然而霸天虎军团也察觉到了这一秘密，他们不惜一切代价想要夺取能量源。
在关键时刻，小明挺身而出，与擎天柱一同并肩作战。
最终在小明和汽车人的共同努力下，他们成功地阻止了霸天虎的阴谋，守护了地球的和平。
而小明也因为他的勇敢和智慧，成为了汽车人和人类共同的英雄。
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