在《游戏王：决斗链接》中，每个角色在达到4级、13级和20级时可以获得一个特定的技能（城之内是在3级时获得技能，可能有特殊意义）。
在平时的决斗中，玩家还有可能通过获得奖励来获取技能。
视频攻略
以下是每个角色的技能效果：
武藤游戏：
黑暗之力：开局环境卡YAMI（暗），魔法师和恶魔族怪兽攻击力增加200点。
魔法感知：生命值低于1800时，在抽牌阶段随机触发，抽到的牌一定是魔法或陷阱。
海马濑人：
至高表现：决斗开始时可在自己的场上发动场地魔法卡「山」，龙族、鸟兽族和雷族怪兽的攻击力和守备力增加200点。
强袭：直到你的回合结束，你场上正面表示的怪兽攻击力上升等级5或以上怪兽数量乘以300点。
该技能每回合只能使用一次。
等级感知：在抽卡阶段，若你的生命值低于1800，可以随机触发，抽到的牌一定是高等级怪兽。
城之内克也：
生命值增强α：决斗开始时，生命值增加1000点。
坚韧不拔：技能会在你的回合开始时随机触发。
直到对手的下个回合结束，你的生命值不会低于1。
援军：当你扣除1500点的生命值时，下个回合可以随机搜索战士族怪兽来替代抽卡。
孔雀舞：
香气策略：你卡组最顶上的卡一直正面朝上。
生命值增强β：决斗开始时，生命值增加1500点，但减少1张初始手牌。
风属性感知：在抽卡阶段，作为通常抽卡的代替，随机抽一张风属性怪兽。
真崎杏子：
圣洁守卫：在自己的回合不会受到战斗伤害。
生命值增强γ：决斗开始时，生命值增加2500点，但减少2张初始手牌。
生命消耗0：只能在你的生命值为1000或以下时发动。
直到对手的下一个回合结束，你可以不支付生命值来发动卡牌的效果。
一个决斗只能使用一次。
昆虫羽蛾：
昆虫暴动：当自己场上有3只昆虫族怪兽时，对面场上的怪兽攻击力都减少800点。
该效果每回合只能触发一次。
低等级感知：在抽卡阶段，若你的生命值低于1800，可以随机触发，抽到的牌一定是低等级怪兽。
通过决斗成功，可以获得的技能：
重启：只能在抽取开始手牌后发动一次。
将你所有手牌返回卡组，再抽取同等数量的手牌。
抽牌替代：在抽卡阶段，作为通常抽卡的替代，可以恢复300点生命值。
每场决斗只能使用三次。
火属性感知：每次你的生命值下降1500时，可以在抽卡阶段，作为通常抽卡的替代，随机抽一张天使族怪兽。
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